Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scaf1Q5U4C3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scaf1Q5U4C3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms