Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdcp1Q5U462 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdcp1Q5U462 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms