Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ankrd40Q5SUE8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms