Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TefmQ5SSK3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms