Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtp3Q5QGU6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtp3Q5QGU6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms