Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Scarf1Q5ND28 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scarf1Q5ND28 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scarf1Q5ND28 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scarf1Q5ND28 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scarf1Q5ND28 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scarf1Q5ND28 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scarf1Q5ND28 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scarf1Q5ND28 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scarf1Q5ND28 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scarf1Q5ND28 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Scarf1Q5ND28 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scarf1Q5ND28 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scarf1Q5ND28 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scarf1Q5ND28 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scarf1Q5ND28 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scarf1Q5ND28 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scarf1Q5ND28 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scarf1Q5ND28 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Scarf1Q5ND28 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scarf1Q5ND28 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scarf1Q5ND28 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scarf1Q5ND28 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms