Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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