Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim58Q5NCC9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms