Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ0

Drosha, Ribonuclease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DroshaQ5HZJ0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DroshaQ5HZJ0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DroshaQ5HZJ0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms