Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnni3kQ5GIG6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnni3kQ5GIG6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms