Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ecm2Q5FW85 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ecm2Q5FW85 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms