Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trpm3Q5F4S9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trpm3Q5F4S9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms