Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q5EBG8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q5EBG8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q5EBG8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q5EBG8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q5EBG8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q5EBG8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q5EBG8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q5EBG8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q5EBG8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q5EBG8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q5EBG8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q5EBG8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q5EBG8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q5EBG8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q5EBG8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q5EBG8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q5EBG8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q5EBG8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q5EBG8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q5EBG8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q5EBG8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q5EBG8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q5EBG8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q5EBG8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q5EBG8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms