Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp22Q5DU02 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms