Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf2Q59J78 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf2Q59J78 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms