Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Urb1Q571H0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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