Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CenpjQ569L8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CenpjQ569L8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms