Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrig2Q52KR2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrig2Q52KR2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms