Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spire1Q52KF3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms