Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl6Q505G4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rtl6Q505G4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rtl6Q505G4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rtl6Q505G4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rtl6Q505G4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rtl6Q505G4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rtl6Q505G4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rtl6Q505G4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rtl6Q505G4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rtl6Q505G4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rtl6Q505G4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rtl6Q505G4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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