Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otol1Q4ZJM7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otol1Q4ZJM7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms