Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem171Q4KL18 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms