Protein–RNA interactions for Protein: Q4FJU9

Tmem40, Transmembrane protein 40, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem40Q4FJU9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tmem40Q4FJU9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tmem40Q4FJU9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tmem40Q4FJU9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tmem40Q4FJU9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tmem40Q4FJU9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tmem40Q4FJU9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tmem40Q4FJU9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tmem40Q4FJU9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmem40Q4FJU9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tmem40Q4FJU9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmem40Q4FJU9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tmem40Q4FJU9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tmem40Q4FJU9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tmem40Q4FJU9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem40Q4FJU9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tmem40Q4FJU9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tmem40Q4FJU9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem40Q4FJU9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tmem40Q4FJU9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem40Q4FJU9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem40Q4FJU9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem40Q4FJU9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tmem40Q4FJU9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem40Q4FJU9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem40Q4FJU9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem40Q4FJU9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem40Q4FJU9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem40Q4FJU9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmem40Q4FJU9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem40Q4FJU9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmem40Q4FJU9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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