Protein–RNA interactions for Protein: Q499M4

Tigd5, Tigger transposable element derived 5, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd5Q499M4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tigd5Q499M4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tigd5Q499M4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tigd5Q499M4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tigd5Q499M4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tigd5Q499M4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tigd5Q499M4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tigd5Q499M4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tigd5Q499M4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tigd5Q499M4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tigd5Q499M4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tigd5Q499M4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tigd5Q499M4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tigd5Q499M4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tigd5Q499M4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tigd5Q499M4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tigd5Q499M4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms