Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt35Q497I4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt35Q497I4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms