Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam220aQ3ZN08 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Fam220aQ3ZN08 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Fam220aQ3ZN08 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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