Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
6430531B16RikQ3V2J1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms