Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Dnah12Q3V0Q1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Dnah12Q3V0Q1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Dnah12Q3V0Q1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dnah12Q3V0Q1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms