Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc43Q3V0L5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc43Q3V0L5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms