Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc114Q3UX62 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms