Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
E330034G19RikQ3UWX6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E330034G19RikQ3UWX6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms