Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pfdn4Q3UWL8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pfdn4Q3UWL8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms