Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm27235Q3UW50 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm27235Q3UW50 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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