Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate2Q3UW31 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms