Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-Eb2Q3UUV9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms