Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ScimpQ3UU41 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms