Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
B230104I21RikQ3USW4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B230104I21RikQ3USW4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms