Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cobll1Q3UMF0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cobll1Q3UMF0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms