Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ctsll3Q3ULP7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms