Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rmdn3Q3UJU9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rmdn3Q3UJU9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms