Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm648Q3UJ22 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm648Q3UJ22 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm648Q3UJ22 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm648Q3UJ22 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm648Q3UJ22 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm648Q3UJ22 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm648Q3UJ22 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm648Q3UJ22 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm648Q3UJ22 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm648Q3UJ22 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm648Q3UJ22 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm648Q3UJ22 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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