Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmod2Q3UHZ5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmod2Q3UHZ5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms