Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc177Q3UHB8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms