Protein–RNA interactions for Protein: Q3UB74

Tbrg1, Transforming growth factor beta regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbrg1Q3UB74 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tbrg1Q3UB74 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tbrg1Q3UB74 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms