Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf166Q3U9F6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf166Q3U9F6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Rnf166Q3U9F6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf166Q3U9F6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms