Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U6N9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U6N9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U6N9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U6N9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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