Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhl21Q3U410 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhl21Q3U410 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms