Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam117bQ3U3E2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam117bQ3U3E2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam117bQ3U3E2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam117bQ3U3E2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam117bQ3U3E2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam117bQ3U3E2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam117bQ3U3E2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam117bQ3U3E2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam117bQ3U3E2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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Fam117bQ3U3E2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam117bQ3U3E2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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