Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rnf40Q3U319 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Rnf40Q3U319 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Rnf40Q3U319 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Rnf40Q3U319 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Rnf40Q3U319 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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