Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc9Q3U0M1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc9Q3U0M1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms